Ülkemizde kolonoskopi fiyatları en alt ve en üst seviyeleri arasında uçurum oluşturacak kadar farklılık göstermektedir. Küçük şehirlerde daha makul seviyedeki kolonoskopi fiyatlarının mevcudiyetine karşın en büyük nüfusa sahip İstanbul gibi bazı kentlerimizde adeta küçük ameliyat fiyatları seviyesinde kolonoskopi fiyatları talep edilebilmektedir.
Kolonoskopi fiyatı aslında standart bir rakam olamaz ve olmamalıdır. Toplumda kolonoskopi olarak bilinen işlem kolonoskop adı verilen ve

video görüntüleme sağlayan flexıble bir cihazla bağırsakların tamamının incelenmesi anlamına gelmektedir. Kolonoskopi bazı durumlarda daha detaylı inceleme yapmak amaçlı ve hatta tedavi boyutunda da yapılmaktadır ki bu durumlarda beyan edilen kolonoskopi fiyatlarının artması kaçınılmazdır. Örneğin kolon kanseri yahut kolon polipleri gelişimine yol açabilecek hücre-doku değişikliklerini kolonoskopi esnasında tespit edebilmesi amaçlı özel boyama teknikleri kullanılması, kolon polipleri ile karşılaşılması halinde bunların kolonoskopi esnasında alınması , devam etmekte olan bağırsak kanaması ile karşılaşıldığında kanamayı durduracak kolonoskopik müdahalelerde bulunulması sizlere sunulmuş olan kolonoskopi fiyatının artmasına neden olabilen durumlardan bazılarıdır.
Kolonoskopi sırasında hemoroidlerin endoskopik tedavileri, alt sindirim sisteminde gelişmiş olduğu tespit edilen darlıkların dilatasyonu (genişletilmesi) ve darlık alanlarına stent yerleştirilmesi gibi daha ileri müdahalelerinde kolonoskopi fiyatını yükselteceği aşikardır.Kolonoskopi fiyatını etkileyen bir başka faktör ise endoskopistin mesleki tecrübesi hususudur. Yapılacak kolonoskopiyi sadece kalın bağırsakların tamamını en alt uçtan kör bağırsağa kadar ilerleyerek geri dönmek yerine, doğru teşhise erişmek adına işlemi o hastanın klinik bulgularına göre şekillendirerek sonuca gitmeye çalışma prensibi ve işlem sonrasında da hastanın tedavi sorumluluğunu yüklenme çabalarının rutin olarak uygulandığı merkezlerde kolonsokopi fiyatları doğal olarak daha yüksek olabilmektedir.
Bazı merkezlerde kolonoskopi yapılırken hastalar işlemi kısmen fark etmekte ve bir miktar ağrı duymaktadırlar.Hastaların kolonoskopiyi hiç fark etmeyecekleri ve hatırlamayacakları boyutta sedasyon (damar içi uyutma) uygulayarak yapan merkezlerde kolonoskopi fiyatlarının daha yüksek olacağı unutulmamalıdır.